Una ricerca italiana condotta da un Istituto di ricerca milanese ha evidenziato il ruolo dei macrofagi nelle allergie e nelle malattie infiammatorie intestinali; i macrofagi oltre ad esercitare un ruolo attivo nella omeostasi prelevano frammenti di cibo per analizzarlo e valutare un'eventuale minaccia in questo per l'organismo. Il loro compito è quello di passare l'informazione a cellule dendritiche che in baso al messaggio ricevuto attivano un meccanismo di tolleranza o di attacco agli alimenti.
Quando i macrofagi non funzionano adeguatamente il sistema immunitario non funziona correttamente e potrebbe scatenare reazioni anche nei confronti di cibi innocui; questo mal funzionamento dei macrofagi pare essere alla base di intolleranze alimentari o allergie.